Projekte der Forschungsgruppe Umweltgenomik und Systembiologie
FoodN’Feed – Lokale Anpassung und Nachhaltigkeit im Anbau von Körnerleguminosen am Beispiel von Sojabohnen
Hülsenfrüchte wie Soja, Ackerbohnen oder Erbsen können sich mithilfe natürlicher Bodenbakterien selbst mit Stickstoff versorgen. Diese Bakterien verwandeln Stickstoff aus der Luft in eine für Pflanzen verwertbare Form. Dadurch wird viel weniger synthetischer Dünger benötigt, wodurch auch weniger Energie verbraucht wird und die Emissionen sinken. Trotzdem wird dieses beeindruckende Zusammenspiel zwischen Pflanzen und Mikroben bislang kaum genutzt.
In unserem Projekt wollen wir herausfinden, welche einheimischen Bakterien und Pilze Schweizer Körnerleguminosen am besten unterstützen. Mithilfe moderner DNA‑Methoden untersuchen wir die Mikroorganismen in den Wurzelknöllchen und im umgebenden Boden. So können wir diejenigen identifizieren, die das Wachstum, die Gesundheit und die Widerstandsfähigkeit der Pflanzen besonders stärken. Die vielversprechendsten Mikrobenstämme wählen wir anschliessend aus, um daraus natürlichen, lokal angepassten Bio‑Dünger zu entwickeln.
Indem wir die bereits vorhandenen mikrobiellen Interaktionen in unseren Böden gezielt fördern, möchten wir die Eiweissproduktion in der Schweiz steigern, Umweltbelastungen senken und zu einem nachhaltigeren Ernährungssystem beitragen. Die erfolgreichsten mikrobiellen Gemeinschaften werden zudem in anderen europäischen Regionen getestet, um die Produktion pflanzlicher Proteine klimaresilienter und auf regionaler Ebene stärker zu machen.
Projektlaufzeit: 04/2026–03/2030
Projektpartner: Ecologie Microbienne - Université Lyon 1
Auftraggeber: SNF / Projekt Nr. 10006234
ARTeDNA – Pilzvielfalt im Königlichen Botanischen Park Bhutan: Boden-eDNA und Kunst für Naturschutz und Kommunikation
ARTeDNA ist ein schweizerisch-bhutanisches Projekt, bei dem die ZHAW und das Nationale Pilzzentrum Bhutans zusammenarbeiten, um die verborgene Vielfalt der Pilze im Königlichen Botanischen Park in Lamperi zu kartieren. Trotz 15 Jahren Feldforschung sind der Wissenschaft weniger als 5 % der Pilzarten Bhutans bekannt. Das Projekt nutzt direkt aus dem Boden gewonnene DNA, um Pilze nachzuweisen, die bei herkömmlichen Erhebungen übersehen werden, bildet gleichzeitig bhutanische Forscher aus und nutzt bildende Kunst, um die Ergebnisse einer breiteren Öffentlichkeit zugänglich zu machen.
Projektdauer: 03/2026–03/2027
Projektpartner: National Mushroom Center (NMC), Department of Agriculture, Ministry of Agriculture and Livestock (Bhutan)
Auftraggeber: Leading House South Asia
Chitin-integrierte Setzlingstöpfe (CHIPOTS+)
Dieses Projekt ist aus einem Open Exploration Workshop hervorgegangen, der vom Innovation Booster von Future Food Farming organisiert wurde, einer von Innosuisse finanzierten Initiative, die Innovation durch Ideenentwicklung und -erprobung unterstützt. Von 2024 bis 2027 zielt der Booster darauf ab, Landwirte und Bürger zu vernetzen, um ein widerstandsfähigeres, nachhaltigeres Schweizer Agrar- und Ernährungssystem aufzubauen, indem radikale, gemeinsam erarbeitete Lösungen durch offene Innovation gefördert werden.
Bei einem Besuch auf dem Biohof Z’Alpenblick in Hirzel haben wir uns mit den Herausforderungen der Wiederherstellung der Verbindung zum Boden beschäftigt. Mithilfe eines problemorientierten Ansatzes und einer Bestandsaufnahme der Interessengruppen ermittelten die Teilnehmer aus verschiedenen Bereichen Möglichkeiten. Diese Vernetzung führte dazu, dass wir einen Vorschlag für die Unterstützung und Entwicklung durch Experten einreichten.
Unser Projekt wurde für die weitere Entwicklung ausgewählt und entwickelte sich über acht Wochen in drei Online-Inkubationssitzungen, die durch einen Innovationsgutschein finanziert wurden. Anschließend stellten wir die Idee einer Jury aus elf Experten vor, die uns zusätzliche Mittel für die weitere Entwicklung im nächsten Jahr zusprachen. Die Einzelheiten des Projekts bleiben zwar vertraulich, aber es nutzt das Fachwissen der Partner, um wichtige Herausforderungen zu bewältigen, die mit dem Auftrag des Innovationsförderers übereinstimmen.
Projektlaufzeit: 12/2024-05/2026
Projektpartner: Suisse Agro Food Leading House, Innovation Booster Future Food Farming, Swiss Food Research, mycostrat GmbH, swissmycel GmbH
Weiterentwicklung einer eDNA-Methode zur Erfassung der Artenvielfalt von Wirbellosen im urbanen Raum
Als essentielle Lebensgrundlage betrifft uns der starke Rückgang der Biodiversität sehr direkt, und trotzdem stellt uns ihr Erhalt vor grosse Herausforderungen. So ist der Verlust an Lebensräumen, gerade in immer dichter besiedelten Gebieten, einer der Hauptverursacher dieser Rückgänge. Um diesen Artenverlusten mit gezielten Massnahmen entgegenzuwirken, sind Methoden das Monitoring der Artenvielfalt wichtig, und genau dort setzt dieses Projekt an. Von diesen Rückgängen sind auch die Wirbellosen, z.B. Spinnen oder Insekten, stark betroffen. Gerade für letztere, als artenreichste Klasse aller Tiere, wurden in den letzten Jahrzehnten sehr grosse Rückgänge dokumentiert.
Wie die meisten Lebewesen hinterlassen auch Insekten oder Spinnen in ihren Lebensräumen Spuren, in welchen sich sehr kleine Mengen ihrer DNA finden lassen. Diese DNA wird auch Umwelt-DNA (oder im englischen eDNA) genannt und in diesem Projekt zunutze gemacht, um ihr Potential für das Erfassen der Biodiversität im urbanen und zersiedelten Raum zu untersuchen. Für die Gewinnung dieser DNA-Spuren werden verschiedene Techniken experimentell getestet und die DNA im Labor mittels Next-Generation Sequencing sequenziert. Dabei soll die Skalierbarkeit auf Orte ausserhalb des Untersuchungsparameters gewährleistet bleiben.
Projektlaufzeit: 06/2024-03/2025
Projektpartner: Extern
Wirkungsgrad von Fern-UV-C und Entwicklung eines Botrytis-Resistenzen-Schnelltests
Die Forschungsgruppe Umweltgenomik und Systembiologie der ZHAW führt parallel zum Forschungsprojekt des Bundesamtes für Landwirtschaft (BLW), «Nicht-chemische Behandlung von Erdbeerjungpflanzen gegen Botrytis cinerea», weitergehende Arbeiten durch. Das Projekt umfasst verschiedene Projektmodule. Es wird untersucht, welche UV-C Wellenlängen effektiver und in der Anwendung sicherer sind (Fern-UV-C). Im Gegensatz zu normalem UV-C kann Fern-UV-C menschliches Gewebe nicht durchdringen. In diesem Modul wird die Wirkung von Fern-UV-C auf verschiedene Erreger getestet und der Wirkungsgrad ermittelt. Im Projektmodul "Schnelltest Entwicklung" wird ein molekularbiologischer Schnelltests zum Nachweis von Botrytis-Resistenzen gegen Botrytizide entwickelt.
Projektlaufzeit: 11/2022-03/2025
Projektpartner: Landwirtschaftliche Zentrum Liebegg
Projektliste
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Machbarkeitsstudie zum nachhaltigen Anbau von Körnerleguminosen und deren lokaler Anpassung am Beispiel der Sojabohne (FoodN'Feed)
Das FoodN'Feed Projekt will die Entwicklung standorttypischer Mikrobiome für einen nachhaltigen Körnerleguminosenanbau in der Schweiz voranbringen. Dazu werden die tatsächlichen Knöllchen-Rhizobien-Gemeinschaften sowie die damit verbundenen Wurzelmikrobiome für die drei in der Schweiz wichtigsten…
laufend, 04/2026 - 03/2030
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Development of a LAMP assay for selective amplification of DNA from living cells
The detection of bacteria using LAMP is well established and widely applied in clinical and veterinary diagnostics, as well as for pathogen detection in food safety and agriculture. The objective of this project is to focus on detecting viable bacterial cells in seed wash solutions. As a model…
laufend, 03/2026 - 05/2028
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AQUAPEALTH: Nutzung von mikrobiellen Gemeinschaften in substratfreien Kulturen zur Verbesserung der Pflanzengesundheit in verschiedenen…
Ziel des Projekts ist es, nachhaltige IPM-Strategien zu entwickeln, die Pflanzengesundheit zu verbessern und die Lücke zwischen Grundlagenforschung und praktischen Anwendungen in substratfreien Systemen zu schliessen, um die Pflanzengesundheit zu verbessern, Pflanzenpathogene zu bekämpfen und die…
laufend, 11/2025 - 04/2027
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Baumschule Grün Stadt Zürich Pilotprojekt
Obwohl Grün Stadt Zürich (GSZ) bereits Ansätze zur Auswahl von Stadtbäumen vorliegen (z.B. Projekt Baumartenwahl), fehlt es zurzeit an einer umfassenden Anpassung an zukünftige Anforderungen hinsichtlich der Resilienz, der Resistenz und einer hohen Biodiversität. Gegenwärtig ist GSZ abhängig von…
laufend, 04/2025 - 12/2028
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Monitoring neue Pflanzsysteme für Grün Stadt Zürich
Im Stadtgebiet Zürich wurden vier Flächen mit verschiedenen Pflanz- und Substratsystemen entwickelt. In Zusammenarbeit mit Grün Stadt Zürich wird auf diesen Flächen die Entwicklung der Vegetation und des Bodens untersucht und dokumentiert. Ziel ist es herauszufinden, welche Vegetationstypen sich auf…
laufend, 01/2025 - 06/2035
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Gefährdete Kleinsäugerarten im Kanton Zürich – Nachweismethoden, Verbreitung und Ökologie
Viele Kleinsäugerarten stehen durch die tiefgreifenden Veränderungen unserer Landschaft vor erheblichen Herausforderungen. Verlust und Degradierung ihrer Lebensräume durch intensivierte Nutzung und Strukturverarmung im landwirtschaftlichen Raum sowie die Zerschneidung der Landschaft durch…
laufend, 01/2025 - 12/2027
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CHIPOTS+: Chitin-Integrated Mycelium-Bound Substrate Blocks for Seedling Boosting
The CHIPOTS+ project aims to reduce peat use in seedling production and restore soil fungal systems using chitin-integrated mycelium-bound substrate blocks. These blocks offer environmental benefits, promote plant growth, and induce resistance to pathogens (ZHAW research). Mycostrat GmbH has…
laufend, 12/2024 - 06/2026
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Development of a biofungicide based on actinobacteria strains isolated from extreme Moroccan ecosystems to protect and improve tomato…
Tomato is a vegetable crop grown in many countries, and its production is constantly increasing. Unfortunately, production can be limited by both abiotic and biotic factors. Fungal pathogens are one of the major factors that reduce crop yield. Botrytis cinerea is a phytopathogenic fungus that causes…
laufend, 12/2024 - 12/2027
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Etablierung einer Vor-Ort-Diagnostik zur Erkennung von Phytophthora-Arten
Phytophthora ramorum / cinnamomi / cambivora sind gefährliche Schadorganismen. Die Unterscheidung zu anderen Arten ist schwierig und erfordert Labortests. Die Praxis wünscht ein mobiles Feldlabor für eine effiziente Vor-Ort-Diagnostik. Dieses Projekt prüft die Praxistauglichkeit von LAMP-Assays…
laufend, 12/2024 - 07/2026
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Loop-mediated isothermal amplification for real-time pathogen screening in soil
The aim of this project is to develop a real-time pathogen screening system for important soil pathogens using loop-mediated isothermal amplification (LAMP) technology. The process will involve the isolation and amplification of DNA from plant, seed or soil samples. A key challenge will be to…
laufend, 11/2024 - 12/2026
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Langfristige Förderung des Seesaiblings (Salvelinus umbla) im Zürichsee
Um langfristig eine stabile Population von Seesaiblingen im Zürichsee zu ermöglichen, werden die bisherigen Massnahmen (der Fischbesatz und die künstlich aufgeschütteten Laichgründe) evaluiert und optimiert. Das Ziel sind Empfehlungen, um unnütze Massnahmen zu terminieren, mässige zu optimieren und…
laufend, 05/2024 - 03/2030
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Development of a kit for the detection of leaf spot in turf grass
The objective is to develop a real-time pathogen detection kit for a range of turf grass leaf spot diseases. This kit will feature a straightforward process for DNA extraction and amplification through loop-mediated isothermal amplification (LAMP). It will enable semi-quantitative assessment of…
abgeschlossen, 04/2024 - 12/2025
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Bioprospektion und Genomik von Actinobakterien isoliert aus der Marchica-Lagune (ActinOmics)
Der massive und übermässige Einsatz von Antibiotika in der Medizin hat zum Auftreten und zur Verbreitung multiresistenter Krankheitserreger geführt, wodurch die Behandlung mit den üblichen Antibiotika unwirksam wird. Zu diesem Phänomen der Antibiotikaresistenz kommt das Auftreten neuer, oftmals…
laufend, 09/2023 - 05/2026
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Massennachweis des Tomato Brown Rugose Fruit Virus durch Hochdurchsatz-Sequenzierung (ToViPoRe)
Die Schweizer Landwirtschaft ist durch das Auftreten des Tomato Brown Rugose Fruit Virus (ToBRFV), auch „Jordanvirus“ genannt, gefährdet. Das Virus, welches Tomaten und Peperoni befällt, kann zu einem massiven Ertragsausfall führen, was für die Produzent:innen erhebliche wirtschaftliche Verluste…
abgeschlossen, 02/2023 - 08/2025
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Modernes Biodiversitätsmonitoring mit Next-Generation Sequencing (NGS-Methoden)
Der Erhalt der genetischen Vielfalt ist ein essentieller Teil des Naturschutzes und ist vom Bund als Teil der prioritären Forschungsthemen für die Jahre 2021-2024 aufgeführt. Entsprechend wichtig ist es, mit Forschungsarbeit und geeigneten Methoden diese genetische Vielfalt zu erfassen, um damit…
abgeschlossen, 01/2023 - 12/2023
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Wirkungsgrad von Fern-UV-C und Entwicklung eines Botrytis-Resistenzen-Schnelltests
Die Forschungsgruppe Umweltgenomik und Systembiologie der ZHAW führt parallel zum Forschungsprojekt des Bundesamtes für Landwirtschaft (BLW), «Nicht-chemische Behandlung von Erdbeerjungpflanzen gegen Botrytis cinerea», weitergehende Arbeiten durch. Das Projekt umfasst verschiedene Projektmodule. Es…
abgeschlossen, 11/2022 - 03/2025
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Erbringung von Dienstleistungen im Bereich Einfuhrkontrollen von lebenden CITES Pflanzen aus der EU
Erbringung von Dienstleistungen im Bereich Einfuhrkontrollen von lebenden CITES Pflanzen aus der Europäischen Union und die Durchführung von Inlandkontrollen.
laufend, 01/2022 - 04/2027
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EBDOmics – Comparative genomics of Enterobacter spp. causing Bulb Decay of Onions
Enterobacter bulb disease of onions (EBDO) is caused by members of the Enterobacter cloacae complex. This includes a diverse group of Enterobacter species that occur as clinical isolates and in the environment. Although EBDO has been known for several years, no systematic study has been conducted on…
abgeschlossen, 01/2022 - 02/2026
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Turf Pathogen Screening System using Loop Mediated Isothermal Amplification
The objective is the development of a real-time pathogen screening system for a group of global relevant turf grass diseases using loop mediated isothermal amplification, LAMP technology. From a turf sample, DNA isolated and amplified using LAMP. Pathogen occurrence in the sample will be detected…
abgeschlossen, 12/2021 - 12/2023
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Fire Blight App for Central Asia
Based on the existing tick app in Switzerland, we will develop an app for smartphones that can inform local populations in Central Asia about fire blight, simultaneously allowing a citizen science approach for mapping the spread of this dangerous pome fruit disease. Utilizing the gathered data, a…
abgeschlossen, 03/2021 - 06/2022