Werkzeuge der vergleichenden Genomik zur Analyse und detaillierten Beschreibung der klinisch relevanten Bakteriengattung Phytobacter

Für viele Bakteriengattungen liegen Genomdaten vor. Dieser Datenschatz wird häufig nicht ausreichend für taxonomische Zwecke, aber auch im Hinblick auf den genomischen Kontext dieser Bakterien untersucht.

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Beschreibung

Die Genome vieler Isolate der opportunistischen, für den Menschen pathogenen Bakteriengattung Phytobacter stehen mittlerweile zur Verfügung. Obwohl es sich um eine seltene Erkrankung handelt, tritt sie im klinischen Umfeld auf, wobei die Erreger eine Panresistenz gegen Beta-Lactam-Antibiotika oder sogar eine Resistenz gegen Polymyxin, das Antibiotikum der letzten Wahl, entwickelt haben.

Hier ist eine detaillierte Untersuchung der Genome aller Phytobacter spp. geplant, um Antibiotikaresistenzen zu identifizieren, aber auch eine Untersuchung der vorhergesagten Physiologie der Arten innerhalb dieser Gattung.